Однако многочисленность организации была также и слабым ее местом. Окончательно придя к мысли о необходимости революции, руководство «Союза Благоденствия» решило вновь реорганизовать тайное общество, попутно избавившись от наименее надежных и полезных его членов. Этому способствовало известие о том, что в Санкт-Петербурге его существование не является секретом, и в Москву выехали официальные лица с целью ареста членов тайного общества. В январе 1821 года Коренная управа объявила о роспуске «Союза Благоденствия».

В марте 1821 года возникло Южное тайное общество на Украине, осенью 1822 года – Северное в Петербурге. Идеологами их стали: Южного – П.И. Пестель, Северного – Никита Муравьев.